根文件系统一般应设置的小一些，因为它包含着重要的文件并且小一些的、不常修改的文件系统就有一个更好的机会不被毁坏掉。一个毁坏的根文件系统通常意味着系统将不能启动了，除非使用特殊方法（例如，从软盘启动），所以你不会去冒这个险的。
根目录通常不包含任何其他文件，除了可能会有些系统的标准启动引导用的影像文件，常称为/vmlinuz。所有其它文件都在根文件系统的子目录中：
/bin
在启动引导期间所需的命令，也可以被普通用户使用（大概在启动引导以后）。
/sbin
如同
/bin，但该目录中的命令不是给普通用户使用的，尽管他们在需要和允许时可能可以使用。
/etc
该目录中存储了与机器有关的配置文件。
/root
用户
root的主目录。
/lib
根文件系统中的程序所需的共享库文件。
/lib/modules
可加载的内核模块，尤其是那些当从灾难中恢复启动引导系统时所需的模块文件（例如，网络以及文件系统驱动程序）。
/dev
设备文件。
/tmp
临时文件。启动后程序运行时应使用
/var/tmp，而非/tmp，因为前者可能在有更大的空间的磁盘上。
/boot
用于系统启动引导加载程序。例如，
LILO。内核影像文件常常是放置在此的，而不是直接放在根目录下。如果有许多内核影像文件，该目录很容易变得很大，因此此时将其置于一个分离独立的文件系统更好些。另一个理由就是要确保内核影像文件被存于IDE磁盘的1024柱面以内。
/mnt
系统管理员为临时加载的加载点。程序不会自动地加载到
/mnt的。/mnt可以再划分成子目录（例如，/mnt/dosa可以是使用MS-DOS文件系统的软驱，/mnt/exta可以是一个ext2文件系统）。
/proc
其它文件系统的加载点。
，/usr，/var，/home
